Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD1Q9UHL9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms