Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cry2Q9R194 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry2Q9R194 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms