Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh2d3cQ9QZS8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d3cQ9QZS8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms