Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn8Q9QZ49 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms