Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA6

Slc7a9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a9Q9QXA6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a9Q9QXA6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc7a9Q9QXA6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc7a9Q9QXA6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc7a9Q9QXA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms