Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A6Q9P2U8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 559.9 ms