Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TVP23BQ9NYZ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23BQ9NYZ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms