Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMOD3Q9NYL9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD3Q9NYL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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