Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDAP2Q9NXN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDAP2Q9NXN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDAP2Q9NXN4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms