Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC17Q9NVM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC17Q9NVM6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms