Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF19Q9NS68 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms