Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO8Q9NRD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO8Q9NRD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO8Q9NRD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO8Q9NRD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms