Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms