Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL1RAPQ9NPH3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms