Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIX2Q9NPC8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIX2Q9NPC8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX2Q9NPC8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms