Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MID1IP1Q9NPA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MID1IP1Q9NPA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1IP1Q9NPA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.3 ms