Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CtsmQ9JL96 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtsmQ9JL96 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsmQ9JL96 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms