Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmx1aQ9JKU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmx1aQ9JKU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms