Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nova1Q9JKN6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nova1Q9JKN6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.8 ms