Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ap3m1Q9JKC8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ap3m1Q9JKC8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap3m1Q9JKC8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms