Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx20Q9JJY4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx20Q9JJY4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms