Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco1Q9JJS6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco1Q9JJS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco1Q9JJS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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