Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Riox1Q9JJF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riox1Q9JJF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riox1Q9JJF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms