Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LratQ9JI60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LratQ9JI60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LratQ9JI60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LratQ9JI60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms