Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREBQ9HCU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREBQ9HCU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREBQ9HCU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms