Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN2Q9H4D0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN2Q9H4D0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN2Q9H4D0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms