Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDCBP2Q9H190 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDCBP2Q9H190 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms