Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA10Q9GZZ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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