Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sall1Q9ER74 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sall1Q9ER74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sall1Q9ER74 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms