Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgf29Q9DA08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgf29Q9DA08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms