Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd2Q9D8U0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd2Q9D8U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd2Q9D8U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms