Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl40Q9D783 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl40Q9D783 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms