Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sf3a3Q9D554 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3a3Q9D554 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3a3Q9D554 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.8 ms