Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fancd2osQ9D4K4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fancd2osQ9D4K4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fancd2osQ9D4K4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms