Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm12Q9D0R8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lsm12Q9D0R8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms