Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdhd3Q9CYW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms