Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk1Q9CXB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alpk1Q9CXB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms