Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smc1aQ9CU62 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms