Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Snw1Q9CSN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms