Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc43Q9CR29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc43Q9CR29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc43Q9CR29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc43Q9CR29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms