Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cntnap2Q9CPW0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap2Q9CPW0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms