Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM15Q9C019 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM15Q9C019 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms