Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMCQ9BYG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms