Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC3Q9BY71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC3Q9BY71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms