Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VN1R3Q9BXE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms