Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC94Q9BW85 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC94Q9BW85 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms