Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED9Q9BVK6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms