Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF1Q9BQI6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF1Q9BQI6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF1Q9BQI6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms