Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf8Q99PV0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms