Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GpnmbQ99P91 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GpnmbQ99P91 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms